Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSSP48449 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSSP48449 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSSP48449 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSSP48449 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSSP48449 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSSP48449 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSSP48449 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSSP48449 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSSP48449 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSSP48449 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSSP48449 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSSP48449 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSSP48449 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSSP48449 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSSP48449 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LSSP48449 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LSSP48449 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSSP48449 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSSP48449 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSSP48449 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSSP48449 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSSP48449 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSSP48449 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSSP48449 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSSP48449 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSSP48449 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSSP48449 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSSP48449 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSSP48449 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSSP48449 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSSP48449 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSSP48449 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSSP48449 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSSP48449 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSSP48449 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSSP48449 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSSP48449 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSSP48449 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSSP48449 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSSP48449 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSSP48449 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSSP48449 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LSSP48449 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSSP48449 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSSP48449 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSSP48449 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSSP48449 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSSP48449 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSSP48449 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSSP48449 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSSP48449 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LSSP48449 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSSP48449 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSSP48449 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSSP48449 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSSP48449 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSSP48449 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSSP48449 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSSP48449 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSSP48449 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSSP48449 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSSP48449 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LSSP48449 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSSP48449 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSSP48449 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSSP48449 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSSP48449 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSSP48449 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSSP48449 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSSP48449 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSSP48449 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSSP48449 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSSP48449 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSSP48449 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSSP48449 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSSP48449 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSSP48449 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSSP48449 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSSP48449 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LSSP48449 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSSP48449 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSSP48449 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSSP48449 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSSP48449 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSSP48449 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSSP48449 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSSP48449 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSSP48449 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LSSP48449 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSSP48449 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSSP48449 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSSP48449 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSSP48449 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSSP48449 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSSP48449 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSSP48449 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSSP48449 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSSP48449 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSSP48449 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms