Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARCN1P48444 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCN1P48444 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms