Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSFP46459 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NSFP46459 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSFP46459 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSFP46459 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSFP46459 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSFP46459 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NSFP46459 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSFP46459 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSFP46459 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSFP46459 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSFP46459 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSFP46459 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSFP46459 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSFP46459 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NSFP46459 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSFP46459 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSFP46459 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NSFP46459 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSFP46459 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSFP46459 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSFP46459 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSFP46459 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSFP46459 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSFP46459 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSFP46459 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSFP46459 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSFP46459 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSFP46459 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSFP46459 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSFP46459 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSFP46459 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSFP46459 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSFP46459 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NSFP46459 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSFP46459 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSFP46459 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSFP46459 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSFP46459 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSFP46459 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSFP46459 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSFP46459 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSFP46459 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSFP46459 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSFP46459 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSFP46459 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSFP46459 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSFP46459 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSFP46459 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSFP46459 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSFP46459 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSFP46459 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSFP46459 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSFP46459 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSFP46459 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSFP46459 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSFP46459 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSFP46459 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSFP46459 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSFP46459 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSFP46459 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSFP46459 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSFP46459 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSFP46459 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSFP46459 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NSFP46459 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSFP46459 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSFP46459 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSFP46459 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSFP46459 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSFP46459 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSFP46459 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSFP46459 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSFP46459 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSFP46459 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSFP46459 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSFP46459 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSFP46459 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NSFP46459 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSFP46459 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NSFP46459 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSFP46459 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSFP46459 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSFP46459 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSFP46459 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSFP46459 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSFP46459 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSFP46459 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSFP46459 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSFP46459 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSFP46459 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSFP46459 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSFP46459 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSFP46459 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSFP46459 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSFP46459 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSFP46459 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSFP46459 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSFP46459 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSFP46459 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms