Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIA2P42262 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIA2P42262 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA2P42262 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms