Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX19P40855 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX19P40855 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX19P40855 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX19P40855 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX19P40855 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX19P40855 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX19P40855 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX19P40855 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX19P40855 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX19P40855 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX19P40855 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX19P40855 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX19P40855 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX19P40855 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX19P40855 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX19P40855 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX19P40855 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX19P40855 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX19P40855 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX19P40855 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX19P40855 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX19P40855 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX19P40855 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX19P40855 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX19P40855 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX19P40855 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX19P40855 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX19P40855 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX19P40855 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX19P40855 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX19P40855 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX19P40855 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX19P40855 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX19P40855 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX19P40855 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX19P40855 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX19P40855 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX19P40855 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX19P40855 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX19P40855 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX19P40855 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX19P40855 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX19P40855 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX19P40855 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX19P40855 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX19P40855 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX19P40855 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX19P40855 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX19P40855 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX19P40855 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX19P40855 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX19P40855 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX19P40855 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PEX19P40855 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX19P40855 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX19P40855 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX19P40855 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX19P40855 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX19P40855 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX19P40855 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX19P40855 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX19P40855 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX19P40855 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX19P40855 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX19P40855 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX19P40855 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX19P40855 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX19P40855 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX19P40855 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX19P40855 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX19P40855 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX19P40855 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX19P40855 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX19P40855 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX19P40855 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX19P40855 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX19P40855 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX19P40855 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX19P40855 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX19P40855 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX19P40855 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX19P40855 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX19P40855 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX19P40855 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX19P40855 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX19P40855 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX19P40855 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX19P40855 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX19P40855 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX19P40855 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX19P40855 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX19P40855 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX19P40855 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX19P40855 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX19P40855 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX19P40855 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX19P40855 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX19P40855 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX19P40855 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms