Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VHLP40337 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VHLP40337 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VHLP40337 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VHLP40337 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VHLP40337 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VHLP40337 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VHLP40337 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VHLP40337 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VHLP40337 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VHLP40337 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VHLP40337 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VHLP40337 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VHLP40337 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VHLP40337 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VHLP40337 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VHLP40337 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VHLP40337 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VHLP40337 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VHLP40337 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VHLP40337 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VHLP40337 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VHLP40337 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VHLP40337 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VHLP40337 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VHLP40337 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VHLP40337 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VHLP40337 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VHLP40337 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VHLP40337 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VHLP40337 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VHLP40337 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VHLP40337 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VHLP40337 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VHLP40337 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VHLP40337 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VHLP40337 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VHLP40337 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VHLP40337 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VHLP40337 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VHLP40337 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VHLP40337 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VHLP40337 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VHLP40337 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VHLP40337 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VHLP40337 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VHLP40337 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VHLP40337 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VHLP40337 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VHLP40337 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VHLP40337 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VHLP40337 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VHLP40337 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VHLP40337 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VHLP40337 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VHLP40337 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VHLP40337 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VHLP40337 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VHLP40337 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VHLP40337 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VHLP40337 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VHLP40337 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VHLP40337 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VHLP40337 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VHLP40337 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VHLP40337 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VHLP40337 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VHLP40337 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VHLP40337 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VHLP40337 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VHLP40337 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VHLP40337 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VHLP40337 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VHLP40337 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VHLP40337 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VHLP40337 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VHLP40337 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VHLP40337 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VHLP40337 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VHLP40337 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VHLP40337 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VHLP40337 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VHLP40337 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VHLP40337 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VHLP40337 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VHLP40337 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VHLP40337 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VHLP40337 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VHLP40337 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VHLP40337 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VHLP40337 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VHLP40337 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VHLP40337 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VHLP40337 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VHLP40337 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VHLP40337 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VHLP40337 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VHLP40337 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VHLP40337 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VHLP40337 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms