Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BMI1P35226 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BMI1P35226 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMI1P35226 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMI1P35226 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMI1P35226 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMI1P35226 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMI1P35226 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMI1P35226 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMI1P35226 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMI1P35226 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BMI1P35226 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMI1P35226 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMI1P35226 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMI1P35226 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMI1P35226 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BMI1P35226 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMI1P35226 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMI1P35226 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BMI1P35226 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BMI1P35226 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BMI1P35226 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BMI1P35226 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BMI1P35226 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BMI1P35226 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BMI1P35226 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BMI1P35226 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BMI1P35226 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BMI1P35226 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BMI1P35226 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BMI1P35226 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BMI1P35226 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BMI1P35226 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BMI1P35226 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BMI1P35226 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BMI1P35226 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BMI1P35226 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BMI1P35226 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BMI1P35226 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BMI1P35226 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BMI1P35226 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BMI1P35226 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BMI1P35226 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BMI1P35226 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BMI1P35226 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BMI1P35226 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BMI1P35226 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BMI1P35226 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BMI1P35226 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BMI1P35226 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BMI1P35226 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BMI1P35226 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BMI1P35226 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BMI1P35226 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BMI1P35226 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BMI1P35226 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BMI1P35226 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BMI1P35226 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BMI1P35226 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BMI1P35226 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
BMI1P35226 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BMI1P35226 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BMI1P35226 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BMI1P35226 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BMI1P35226 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BMI1P35226 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BMI1P35226 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BMI1P35226 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BMI1P35226 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BMI1P35226 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BMI1P35226 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BMI1P35226 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BMI1P35226 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BMI1P35226 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BMI1P35226 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BMI1P35226 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BMI1P35226 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BMI1P35226 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BMI1P35226 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BMI1P35226 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BMI1P35226 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BMI1P35226 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BMI1P35226 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BMI1P35226 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BMI1P35226 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BMI1P35226 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BMI1P35226 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BMI1P35226 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BMI1P35226 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BMI1P35226 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BMI1P35226 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms