Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNB1P35222 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNB1P35222 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTNNB1P35222 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms