Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HOXA10P31260 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HOXA10P31260 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXA10P31260 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HOXA10P31260 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXA10P31260 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXA10P31260 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HOXA10P31260 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms