Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA3P29320 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA3P29320 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHA3P29320 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms