Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBG1P23258 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBG1P23258 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms