Protein–RNA interactions for Protein: P21549

AGXT, Serine--pyruvate aminotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGXTP21549 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGXTP21549 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGXTP21549 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGXTP21549 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGXTP21549 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGXTP21549 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGXTP21549 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGXTP21549 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGXTP21549 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGXTP21549 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGXTP21549 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGXTP21549 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGXTP21549 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGXTP21549 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGXTP21549 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGXTP21549 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGXTP21549 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGXTP21549 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGXTP21549 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGXTP21549 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGXTP21549 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGXTP21549 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGXTP21549 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGXTP21549 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGXTP21549 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGXTP21549 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGXTP21549 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGXTP21549 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGXTP21549 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGXTP21549 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGXTP21549 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AGXTP21549 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGXTP21549 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGXTP21549 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGXTP21549 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGXTP21549 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGXTP21549 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGXTP21549 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AGXTP21549 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGXTP21549 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGXTP21549 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGXTP21549 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms