Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ITGB4P16144 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGB4P16144 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGB4P16144 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
ITGB4P16144 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms