Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYL4P12829 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYL4P12829 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MYL4P12829 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYL4P12829 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYL4P12829 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYL4P12829 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYL4P12829 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYL4P12829 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYL4P12829 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYL4P12829 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYL4P12829 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYL4P12829 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYL4P12829 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYL4P12829 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYL4P12829 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYL4P12829 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYL4P12829 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYL4P12829 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYL4P12829 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYL4P12829 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYL4P12829 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYL4P12829 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYL4P12829 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYL4P12829 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYL4P12829 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYL4P12829 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYL4P12829 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYL4P12829 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYL4P12829 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYL4P12829 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL4P12829 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL4P12829 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL4P12829 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL4P12829 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL4P12829 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL4P12829 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYL4P12829 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYL4P12829 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYL4P12829 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYL4P12829 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYL4P12829 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYL4P12829 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYL4P12829 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYL4P12829 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL4P12829 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL4P12829 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL4P12829 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYL4P12829 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYL4P12829 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYL4P12829 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYL4P12829 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYL4P12829 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYL4P12829 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYL4P12829 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYL4P12829 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL4P12829 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL4P12829 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL4P12829 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL4P12829 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL4P12829 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL4P12829 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL4P12829 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL4P12829 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL4P12829 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL4P12829 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL4P12829 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL4P12829 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYL4P12829 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYL4P12829 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYL4P12829 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MYL4P12829 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL4P12829 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL4P12829 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL4P12829 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL4P12829 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL4P12829 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL4P12829 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL4P12829 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL4P12829 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL4P12829 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL4P12829 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL4P12829 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL4P12829 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL4P12829 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL4P12829 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL4P12829 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL4P12829 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL4P12829 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL4P12829 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL4P12829 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL4P12829 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL4P12829 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL4P12829 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL4P12829 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL4P12829 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYL4P12829 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYL4P12829 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYL4P12829 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYL4P12829 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms