Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFNA6P05013 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA6P05013 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA6P05013 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA6P05013 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA6P05013 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IFNA6P05013 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA6P05013 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA6P05013 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA6P05013 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA6P05013 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFNA6P05013 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA6P05013 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA6P05013 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA6P05013 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA6P05013 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA6P05013 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA6P05013 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA6P05013 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA6P05013 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA6P05013 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA6P05013 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA6P05013 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA6P05013 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA6P05013 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA6P05013 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA6P05013 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA6P05013 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA6P05013 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms