Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPSP04118 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPSP04118 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPSP04118 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPSP04118 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPSP04118 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPSP04118 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPSP04118 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPSP04118 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPSP04118 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPSP04118 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPSP04118 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPSP04118 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPSP04118 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPSP04118 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPSP04118 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPSP04118 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPSP04118 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPSP04118 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPSP04118 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPSP04118 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPSP04118 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPSP04118 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPSP04118 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPSP04118 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPSP04118 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPSP04118 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPSP04118 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPSP04118 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPSP04118 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPSP04118 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPSP04118 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPSP04118 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPSP04118 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPSP04118 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPSP04118 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPSP04118 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPSP04118 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPSP04118 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPSP04118 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPSP04118 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPSP04118 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPSP04118 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPSP04118 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPSP04118 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPSP04118 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPSP04118 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPSP04118 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPSP04118 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPSP04118 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPSP04118 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPSP04118 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPSP04118 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPSP04118 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPSP04118 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPSP04118 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLPSP04118 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLPSP04118 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPSP04118 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPSP04118 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPSP04118 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPSP04118 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPSP04118 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPSP04118 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPSP04118 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPSP04118 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPSP04118 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPSP04118 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPSP04118 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPSP04118 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPSP04118 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPSP04118 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPSP04118 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPSP04118 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPSP04118 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPSP04118 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPSP04118 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPSP04118 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPSP04118 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPSP04118 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPSP04118 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPSP04118 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPSP04118 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPSP04118 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPSP04118 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPSP04118 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPSP04118 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPSP04118 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPSP04118 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPSP04118 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPSP04118 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPSP04118 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPSP04118 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPSP04118 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPSP04118 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPSP04118 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPSP04118 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPSP04118 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPSP04118 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPSP04118 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms