Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBC1P01850 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBC1P01850 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRBC1P01850 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC1P01850 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms