Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF6BO95407 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF6BO95407 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms