Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LPXNO60711 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LPXNO60711 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LPXNO60711 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPXNO60711 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPXNO60711 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPXNO60711 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPXNO60711 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LPXNO60711 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LPXNO60711 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LPXNO60711 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LPXNO60711 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LPXNO60711 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LPXNO60711 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LPXNO60711 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LPXNO60711 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPXNO60711 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPXNO60711 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPXNO60711 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPXNO60711 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPXNO60711 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPXNO60711 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LPXNO60711 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LPXNO60711 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPXNO60711 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPXNO60711 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPXNO60711 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPXNO60711 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPXNO60711 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPXNO60711 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LPXNO60711 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LPXNO60711 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LPXNO60711 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LPXNO60711 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LPXNO60711 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LPXNO60711 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LPXNO60711 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LPXNO60711 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LPXNO60711 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LPXNO60711 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LPXNO60711 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LPXNO60711 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LPXNO60711 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LPXNO60711 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LPXNO60711 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LPXNO60711 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LPXNO60711 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LPXNO60711 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LPXNO60711 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LPXNO60711 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LPXNO60711 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LPXNO60711 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LPXNO60711 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LPXNO60711 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LPXNO60711 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LPXNO60711 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LPXNO60711 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPXNO60711 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LPXNO60711 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LPXNO60711 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPXNO60711 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPXNO60711 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPXNO60711 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LPXNO60711 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LPXNO60711 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LPXNO60711 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LPXNO60711 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPXNO60711 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPXNO60711 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LPXNO60711 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LPXNO60711 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LPXNO60711 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LPXNO60711 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LPXNO60711 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LPXNO60711 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LPXNO60711 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LPXNO60711 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LPXNO60711 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPXNO60711 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPXNO60711 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPXNO60711 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPXNO60711 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPXNO60711 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPXNO60711 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LPXNO60711 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPXNO60711 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPXNO60711 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPXNO60711 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPXNO60711 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPXNO60711 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LPXNO60711 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LPXNO60711 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LPXNO60711 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LPXNO60711 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LPXNO60711 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LPXNO60711 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LPXNO60711 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPXNO60711 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPXNO60711 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPXNO60711 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms