Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD1O60671 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD1O60671 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD1O60671 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD1O60671 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD1O60671 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD1O60671 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD1O60671 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD1O60671 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD1O60671 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD1O60671 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD1O60671 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD1O60671 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD1O60671 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD1O60671 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD1O60671 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD1O60671 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD1O60671 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD1O60671 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD1O60671 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD1O60671 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD1O60671 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD1O60671 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD1O60671 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD1O60671 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD1O60671 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD1O60671 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD1O60671 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD1O60671 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD1O60671 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD1O60671 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD1O60671 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD1O60671 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD1O60671 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD1O60671 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD1O60671 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD1O60671 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD1O60671 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD1O60671 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD1O60671 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD1O60671 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD1O60671 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD1O60671 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD1O60671 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD1O60671 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD1O60671 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD1O60671 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD1O60671 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD1O60671 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD1O60671 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD1O60671 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD1O60671 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD1O60671 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD1O60671 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD1O60671 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD1O60671 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD1O60671 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD1O60671 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD1O60671 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD1O60671 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD1O60671 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD1O60671 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD1O60671 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD1O60671 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD1O60671 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD1O60671 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD1O60671 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD1O60671 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD1O60671 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD1O60671 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD1O60671 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD1O60671 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD1O60671 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD1O60671 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD1O60671 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD1O60671 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD1O60671 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD1O60671 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD1O60671 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD1O60671 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD1O60671 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD1O60671 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD1O60671 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD1O60671 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD1O60671 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD1O60671 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD1O60671 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD1O60671 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD1O60671 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD1O60671 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD1O60671 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD1O60671 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD1O60671 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD1O60671 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD1O60671 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD1O60671 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD1O60671 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD1O60671 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD1O60671 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD1O60671 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms