Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PLXNC1O60486 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PLXNC1O60486 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PLXNC1O60486 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PLXNC1O60486 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PLXNC1O60486 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PLXNC1O60486 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PLXNC1O60486 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PLXNC1O60486 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PLXNC1O60486 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PLXNC1O60486 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PLXNC1O60486 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PLXNC1O60486 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms