Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KALRNO60229 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KALRNO60229 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KALRNO60229 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KALRNO60229 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KALRNO60229 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KALRNO60229 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KALRNO60229 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KALRNO60229 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KALRNO60229 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KALRNO60229 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KALRNO60229 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KALRNO60229 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KALRNO60229 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KALRNO60229 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KALRNO60229 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KALRNO60229 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KALRNO60229 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KALRNO60229 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KALRNO60229 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KALRNO60229 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KALRNO60229 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KALRNO60229 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KALRNO60229 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KALRNO60229 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KALRNO60229 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KALRNO60229 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KALRNO60229 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KALRNO60229 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KALRNO60229 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KALRNO60229 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KALRNO60229 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KALRNO60229 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KALRNO60229 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KALRNO60229 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KALRNO60229 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KALRNO60229 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KALRNO60229 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KALRNO60229 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KALRNO60229 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KALRNO60229 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KALRNO60229 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KALRNO60229 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KALRNO60229 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KALRNO60229 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KALRNO60229 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KALRNO60229 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KALRNO60229 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KALRNO60229 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KALRNO60229 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KALRNO60229 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KALRNO60229 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KALRNO60229 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KALRNO60229 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KALRNO60229 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KALRNO60229 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KALRNO60229 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KALRNO60229 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KALRNO60229 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KALRNO60229 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KALRNO60229 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KALRNO60229 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KALRNO60229 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KALRNO60229 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KALRNO60229 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KALRNO60229 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KALRNO60229 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KALRNO60229 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KALRNO60229 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KALRNO60229 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KALRNO60229 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KALRNO60229 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KALRNO60229 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KALRNO60229 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KALRNO60229 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KALRNO60229 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KALRNO60229 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KALRNO60229 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KALRNO60229 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KALRNO60229 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KALRNO60229 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KALRNO60229 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KALRNO60229 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KALRNO60229 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KALRNO60229 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KALRNO60229 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KALRNO60229 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KALRNO60229 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KALRNO60229 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KALRNO60229 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms