Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IDH3BO43837 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IDH3BO43837 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3BO43837 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms