Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCK2O43639 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCK2O43639 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCK2O43639 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCK2O43639 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCK2O43639 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCK2O43639 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCK2O43639 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCK2O43639 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCK2O43639 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCK2O43639 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCK2O43639 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCK2O43639 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCK2O43639 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCK2O43639 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCK2O43639 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCK2O43639 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCK2O43639 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCK2O43639 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCK2O43639 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCK2O43639 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCK2O43639 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCK2O43639 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCK2O43639 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCK2O43639 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCK2O43639 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCK2O43639 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCK2O43639 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCK2O43639 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCK2O43639 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCK2O43639 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NCK2O43639 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCK2O43639 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCK2O43639 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCK2O43639 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCK2O43639 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCK2O43639 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCK2O43639 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCK2O43639 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCK2O43639 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCK2O43639 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCK2O43639 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCK2O43639 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCK2O43639 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCK2O43639 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCK2O43639 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCK2O43639 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCK2O43639 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCK2O43639 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NCK2O43639 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCK2O43639 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCK2O43639 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NCK2O43639 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCK2O43639 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCK2O43639 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCK2O43639 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCK2O43639 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCK2O43639 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCK2O43639 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCK2O43639 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCK2O43639 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCK2O43639 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCK2O43639 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCK2O43639 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCK2O43639 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCK2O43639 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCK2O43639 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCK2O43639 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCK2O43639 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCK2O43639 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCK2O43639 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCK2O43639 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCK2O43639 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCK2O43639 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCK2O43639 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCK2O43639 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCK2O43639 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCK2O43639 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCK2O43639 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCK2O43639 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCK2O43639 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCK2O43639 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCK2O43639 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCK2O43639 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCK2O43639 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCK2O43639 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCK2O43639 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCK2O43639 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCK2O43639 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCK2O43639 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCK2O43639 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCK2O43639 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCK2O43639 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCK2O43639 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCK2O43639 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCK2O43639 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NCK2O43639 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCK2O43639 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCK2O43639 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCK2O43639 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms