Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC7A4O43246 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC7A4O43246 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC7A4O43246 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms