Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEPT4O43236 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEPT4O43236 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEPT4O43236 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEPT4O43236 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEPT4O43236 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SEPT4O43236 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SEPT4O43236 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SEPT4O43236 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SEPT4O43236 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEPT4O43236 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEPT4O43236 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEPT4O43236 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEPT4O43236 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms