Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM6AO15550 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
KDM6AO15550 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM6AO15550 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM6AO15550 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6AO15550 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM6AO15550 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6AO15550 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6AO15550 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6AO15550 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM6AO15550 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6AO15550 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6AO15550 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6AO15550 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms