Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TO15178 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TO15178 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TO15178 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TO15178 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TO15178 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TO15178 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TO15178 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TO15178 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TO15178 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TO15178 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TO15178 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TO15178 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TO15178 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TO15178 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TO15178 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TO15178 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TO15178 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TO15178 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TO15178 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TO15178 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TO15178 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TO15178 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TO15178 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TO15178 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TO15178 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TO15178 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TO15178 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TO15178 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TO15178 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TO15178 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TO15178 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TO15178 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TO15178 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TO15178 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TO15178 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TO15178 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TO15178 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TO15178 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TO15178 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TO15178 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TO15178 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TO15178 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TO15178 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TO15178 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TO15178 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TO15178 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TO15178 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TO15178 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TO15178 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TO15178 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TO15178 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TO15178 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TO15178 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TO15178 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TO15178 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TO15178 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TO15178 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TO15178 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TO15178 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TO15178 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TO15178 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TO15178 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TO15178 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TO15178 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TO15178 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TO15178 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TO15178 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TO15178 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TO15178 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TO15178 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TO15178 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TO15178 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TO15178 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TO15178 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TO15178 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TO15178 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TO15178 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TO15178 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TO15178 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TO15178 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TO15178 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TO15178 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TO15178 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TO15178 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TO15178 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TO15178 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TO15178 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TO15178 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TO15178 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms