Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GIPC1O14908 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GIPC1O14908 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GIPC1O14908 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms