Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE2AO00408 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDE2AO00408 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE2AO00408 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE2AO00408 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE2AO00408 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms