Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms