Protein–RNA interactions for Protein: H3BQB6

STMND1, Stathmin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMND1H3BQB6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STMND1H3BQB6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
STMND1H3BQB6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STMND1H3BQB6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STMND1H3BQB6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STMND1H3BQB6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms