Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PQ18 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PQ18 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PQ18 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PQ18 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PQ18 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PQ18 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PQ18 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PQ18 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PQ18 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PQ18 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PQ18 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PQ18 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PQ18 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PQ18 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PQ18 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PQ18 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PQ18 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PQ18 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PQ18 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PQ18 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PQ18 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PQ18 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PQ18 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PQ18 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PQ18 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PQ18 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PQ18 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PQ18 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PQ18 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PQ18 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PQ18 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PQ18 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PQ18 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PQ18 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PQ18 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PQ18 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PQ18 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PQ18 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PQ18 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PQ18 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PQ18 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PQ18 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PQ18 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PQ18 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PQ18 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PQ18 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PQ18 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PQ18 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PQ18 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PQ18 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PQ18 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PQ18 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PQ18 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PQ18 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PQ18 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PQ18 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PQ18 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PQ18 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PQ18 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PQ18 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PQ18 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PQ18 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PQ18 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PQ18 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PQ18 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PQ18 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PQ18 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PQ18 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PQ18 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PQ18 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PQ18 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PQ18 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PQ18 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PQ18 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PQ18 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PQ18 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PQ18 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PQ18 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PQ18 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PQ18 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PQ18 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PQ18 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PQ18 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PQ18 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PQ18 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PQ18 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PQ18 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PQ18 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PQ18 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PQ18 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PQ18 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PQ18 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PQ18 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PQ18 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PQ18 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PQ18 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PQ18 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PQ18 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PQ18 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms