Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZ34

SHISA8, Putative protein shisa-8, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA8B8ZZ34 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA8B8ZZ34 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA8B8ZZ34 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA8B8ZZ34 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA8B8ZZ34 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms