Protein–RNA interactions for Protein: A8MVW0

FAM171A2, Protein FAM171A2, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM171A2A8MVW0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM171A2A8MVW0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM171A2A8MVW0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM171A2A8MVW0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM171A2A8MVW0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM171A2A8MVW0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM171A2A8MVW0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM171A2A8MVW0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM171A2A8MVW0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM171A2A8MVW0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM171A2A8MVW0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM171A2A8MVW0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM171A2A8MVW0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms