Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR3A8MPY1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRR3A8MPY1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRR3A8MPY1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms