Protein–RNA interactions for Protein: A6NM36

LRRC30, Leucine-rich repeat-containing protein 30, humanhuman

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC30A6NM36 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC30A6NM36 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC30A6NM36 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC30A6NM36 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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