Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAC3D1A6NKF1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAC3D1A6NKF1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAC3D1A6NKF1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAC3D1A6NKF1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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