Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNDIG1LA6NDD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNDIG1LA6NDD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1LA6NDD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms