Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA1A5PL33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA1A5PL33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRBA1A5PL33 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA1A5PL33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRBA1A5PL33 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA1A5PL33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA1A5PL33 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms