Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1B0GTW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1B0GTW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1B0GTW7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1B0GTW7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1B0GTW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1B0GTW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1B0GTW7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms