Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.781e-56■□□□□ 8.2
NIPBLQ6KC79 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.521e-56■□□□□ 8.2
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NIPBLQ6KC79 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.84e-41■□□□□ 8.2
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NIPBLQ6KC79 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.384e-41■□□□□ 8.2
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NIPBLQ6KC79 XRCC2-202ENST00000495707 4728 ntTSL 1 (best)5.66□□□□□ -1.59e-18■□□□□ 8.1
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