Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19not detected
NIPBLQ6KC79 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16not detected
NIPBLQ6KC79 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08not detected
NIPBLQ6KC79 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04not detected
NIPBLQ6KC79 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03not detected
NIPBLQ6KC79 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02not detected
NIPBLQ6KC79 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2not detected
NIPBLQ6KC79 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97not detected
NIPBLQ6KC79 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97not detected
NIPBLQ6KC79 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97not detected
NIPBLQ6KC79 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97not detected
NIPBLQ6KC79 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.935e-9■□□□□ 9.8
NIPBLQ6KC79 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92not detected
NIPBLQ6KC79 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.919e-7■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89not detected
NIPBLQ6KC79 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89not detected
NIPBLQ6KC79 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89not detected
NIPBLQ6KC79 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88not detected
NIPBLQ6KC79 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86not detected
NIPBLQ6KC79 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84not detected
NIPBLQ6KC79 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84not detected
NIPBLQ6KC79 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83not detected
NIPBLQ6KC79 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83not detected
NIPBLQ6KC79 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82not detected
NIPBLQ6KC79 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82not detected
NIPBLQ6KC79 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82not detected
NIPBLQ6KC79 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82not detected
NIPBLQ6KC79 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79not detected
NIPBLQ6KC79 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79not detected
NIPBLQ6KC79 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78not detected
NIPBLQ6KC79 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77not detected
NIPBLQ6KC79 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76not detected
NIPBLQ6KC79 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76not detected
NIPBLQ6KC79 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73not detected
NIPBLQ6KC79 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.739e-15■■■■■ 39
NIPBLQ6KC79 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.739e-15■■■■■ 39
NIPBLQ6KC79 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72not detected
NIPBLQ6KC79 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.722e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72not detected
NIPBLQ6KC79 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72not detected
NIPBLQ6KC79 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71not detected
NIPBLQ6KC79 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71not detected
NIPBLQ6KC79 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7not detected
NIPBLQ6KC79 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69not detected
NIPBLQ6KC79 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69not detected
NIPBLQ6KC79 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68not detected
NIPBLQ6KC79 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68not detected
NIPBLQ6KC79 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67not detected
NIPBLQ6KC79 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66not detected
NIPBLQ6KC79 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66not detected
NIPBLQ6KC79 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65not detected
NIPBLQ6KC79 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■■ 33.8
NIPBLQ6KC79 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64not detected
NIPBLQ6KC79 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64not detected
NIPBLQ6KC79 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64not detected
NIPBLQ6KC79 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64not detected
NIPBLQ6KC79 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63not detected
NIPBLQ6KC79 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63not detected
NIPBLQ6KC79 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63not detected
NIPBLQ6KC79 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62not detected
NIPBLQ6KC79 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61not detected
NIPBLQ6KC79 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61not detected
NIPBLQ6KC79 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61not detected
NIPBLQ6KC79 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61not detected
NIPBLQ6KC79 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61not detected
NIPBLQ6KC79 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6not detected
NIPBLQ6KC79 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6not detected
NIPBLQ6KC79 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6not detected
NIPBLQ6KC79 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59not detected
NIPBLQ6KC79 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59not detected
NIPBLQ6KC79 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59not detected
NIPBLQ6KC79 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59not detected
NIPBLQ6KC79 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59not detected
NIPBLQ6KC79 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59not detected
NIPBLQ6KC79 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59not detected
NIPBLQ6KC79 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59not detected
NIPBLQ6KC79 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59not detected
NIPBLQ6KC79 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58not detected
NIPBLQ6KC79 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58not detected
NIPBLQ6KC79 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58not detected
NIPBLQ6KC79 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58not detected
NIPBLQ6KC79 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57not detected
NIPBLQ6KC79 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57not detected
NIPBLQ6KC79 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57not detected
NIPBLQ6KC79 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57not detected
NIPBLQ6KC79 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57not detected
NIPBLQ6KC79 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56not detected
NIPBLQ6KC79 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56not detected
NIPBLQ6KC79 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55not detected
NIPBLQ6KC79 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55not detected
NIPBLQ6KC79 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55not detected
NIPBLQ6KC79 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54not detected
NIPBLQ6KC79 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54not detected
NIPBLQ6KC79 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54not detected
NIPBLQ6KC79 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54not detected
NIPBLQ6KC79 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54not detected
NIPBLQ6KC79 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53not detected
NIPBLQ6KC79 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53not detected
NIPBLQ6KC79 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53not detected
NIPBLQ6KC79 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms