RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518786.1

C8orf59-202, Transcript of chromosome 8 open reading frame 59, humanhuman

TSL 2

Gene C8orf59, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf59-202ENST00000518786 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
C8orf59-202ENST00000518786 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.15■■■■□ 3.54
C8orf59-202ENST00000518786 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
C8orf59-202ENST00000518786 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
C8orf59-202ENST00000518786 FOXD1Q16676 465 aa31.65■■■□□ 2.66
C8orf59-202ENST00000518786 POTEDQ86YR6 584 aa30.13■■■□□ 2.41
C8orf59-202ENST00000518786 MSH5O43196 834 aa29.7■■■□□ 2.35
C8orf59-202ENST00000518786 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.47■■■□□ 2.31
C8orf59-202ENST00000518786 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
C8orf59-202ENST00000518786 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.23■■■□□ 2.27
C8orf59-202ENST00000518786 ADRA2BP18089 450 aa29.1■■■□□ 2.25
C8orf59-202ENST00000518786 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
C8orf59-202ENST00000518786 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.71■■□□□ 1.87
C8orf59-202ENST00000518786 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
C8orf59-202ENST00000518786 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
C8orf59-202ENST00000518786 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.81■■□□□ 1.72
C8orf59-202ENST00000518786 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.71■■□□□ 1.71
C8orf59-202ENST00000518786 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
C8orf59-202ENST00000518786 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.39■■□□□ 1.66
C8orf59-202ENST00000518786 RNF39Q9H2S5 420 aa25.38■■□□□ 1.65
C8orf59-202ENST00000518786 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
C8orf59-202ENST00000518786 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
C8orf59-202ENST00000518786 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.72■■□□□ 1.55
C8orf59-202ENST00000518786 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
C8orf59-202ENST00000518786 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
C8orf59-202ENST00000518786 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
C8orf59-202ENST00000518786 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
C8orf59-202ENST00000518786 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
C8orf59-202ENST00000518786 DSG3P32926 999 aa23.58■■□□□ 1.37
C8orf59-202ENST00000518786 CAPN15O75808 1086 aa23.57■■□□□ 1.36
C8orf59-202ENST00000518786 KCNA4P22459 653 aa23.56■■□□□ 1.36
C8orf59-202ENST00000518786 POTEHQ6S545 545 aa23.46■■□□□ 1.35
C8orf59-202ENST00000518786 SLC4A2P04920 1241 aa23.39■■□□□ 1.33
C8orf59-202ENST00000518786 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
C8orf59-202ENST00000518786 ABCB7O75027 752 aa23.05■■□□□ 1.28
C8orf59-202ENST00000518786 APLP2Q06481 763 aa23■■□□□ 1.27
C8orf59-202ENST00000518786 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
C8orf59-202ENST00000518786 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
C8orf59-202ENST00000518786 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
C8orf59-202ENST00000518786 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
C8orf59-202ENST00000518786 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
C8orf59-202ENST00000518786 POLA2Q14181 598 aa22.39■■□□□ 1.17
C8orf59-202ENST00000518786 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
C8orf59-202ENST00000518786 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.24■■□□□ 1.15
C8orf59-202ENST00000518786 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C8orf59-202ENST00000518786 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C8orf59-202ENST00000518786 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.06■■□□□ 1.12
C8orf59-202ENST00000518786 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
C8orf59-202ENST00000518786 AKT1S1Q96B36 256 aa21.82■■□□□ 1.08
C8orf59-202ENST00000518786 OSCARQ8IYS5 282 aa21.72■■□□□ 1.07
C8orf59-202ENST00000518786 ZBTB22O15209 634 aa21.7■■□□□ 1.06
C8orf59-202ENST00000518786 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
C8orf59-202ENST00000518786 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
C8orf59-202ENST00000518786 PIP4P2Q8N4L2 257 aa21.62■■□□□ 1.05
C8orf59-202ENST00000518786 PITPNM1O00562 1244 aa21.46■■□□□ 1.03
C8orf59-202ENST00000518786 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.39■■□□□ 1.01
C8orf59-202ENST00000518786 HAX1O00165 279 aa21.36■■□□□ 1.01
C8orf59-202ENST00000518786 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
C8orf59-202ENST00000518786 EVX2Q03828 476 aa21.17■□□□□ 0.98
C8orf59-202ENST00000518786 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.16■□□□□ 0.98
C8orf59-202ENST00000518786 SPDYE6P0CI01 402 aa21.16■□□□□ 0.98
C8orf59-202ENST00000518786 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.16■□□□□ 0.98
C8orf59-202ENST00000518786 FBLN2P98095 1184 aa21.14■□□□□ 0.97
C8orf59-202ENST00000518786 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
C8orf59-202ENST00000518786 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.9■□□□□ 0.94
C8orf59-202ENST00000518786 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
C8orf59-202ENST00000518786 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
C8orf59-202ENST00000518786 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.87■□□□□ 0.93
C8orf59-202ENST00000518786 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
C8orf59-202ENST00000518786 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.69■□□□□ 0.9
C8orf59-202ENST00000518786 CHADLQ6NUI6 762 aa20.6■□□□□ 0.89
C8orf59-202ENST00000518786 GABBR2O75899 941 aa20.56■□□□□ 0.88
C8orf59-202ENST00000518786 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
C8orf59-202ENST00000518786 PRR29P0C7W0 189 aa20.47■□□□□ 0.87
C8orf59-202ENST00000518786 LHX8Q68G74 356 aa20.36■□□□□ 0.85
C8orf59-202ENST00000518786 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.31■□□□□ 0.84
C8orf59-202ENST00000518786 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
C8orf59-202ENST00000518786 POTEIP0CG38 1075 aa20.19■□□□□ 0.82
C8orf59-202ENST00000518786 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
C8orf59-202ENST00000518786 CREBZFQ9NS37 354 aa19.92■□□□□ 0.78
C8orf59-202ENST00000518786 CLCN6P51797 869 aa19.89■□□□□ 0.77
C8orf59-202ENST00000518786 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
C8orf59-202ENST00000518786 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.84■□□□□ 0.77
C8orf59-202ENST00000518786 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.83■□□□□ 0.77
C8orf59-202ENST00000518786 DCBLD2Q96PD2 775 aa19.83■□□□□ 0.77
C8orf59-202ENST00000518786 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.83■□□□□ 0.77
C8orf59-202ENST00000518786 SPDYE4A6NLX3 237 aa19.8■□□□□ 0.76
C8orf59-202ENST00000518786 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
C8orf59-202ENST00000518786 PLSCR2Q9NRY7 297 aa19.59■□□□□ 0.73
C8orf59-202ENST00000518786 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
C8orf59-202ENST00000518786 PHF12Q96QT6 1004 aa19.56■□□□□ 0.72
C8orf59-202ENST00000518786 POTEB2H3BUK9 544 aa19.54■□□□□ 0.72
C8orf59-202ENST00000518786 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
C8orf59-202ENST00000518786 OTUD5Q96G74 571 aa19.52■□□□□ 0.72
C8orf59-202ENST00000518786 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
C8orf59-202ENST00000518786 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
C8orf59-202ENST00000518786 PROM2Q8N271 834 aa19.29■□□□□ 0.68
C8orf59-202ENST00000518786 MS4A3Q96HJ5 214 aa19.28■□□□□ 0.68
C8orf59-202ENST00000518786 POTEMA6NI47 508 aa19.21■□□□□ 0.67
C8orf59-202ENST00000518786 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.3 ms