Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.45■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.42■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms