Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX11Q9Y5W9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX11Q9Y5W9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX11Q9Y5W9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX11Q9Y5W9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms