Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GTF3C3Q9Y5Q9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GTF3C3Q9Y5Q9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GTF3C3Q9Y5Q9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GTF3C3Q9Y5Q9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
GTF3C3Q9Y5Q9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms