Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCAF1Q9Y4C2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCAF1Q9Y4C2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCAF1Q9Y4C2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF1Q9Y4C2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TCAF1Q9Y4C2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.3 ms