Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GINS2Q9Y248 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GINS2Q9Y248 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GINS2Q9Y248 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GINS2Q9Y248 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms