Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
IQSEC3Q9UPP2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
IQSEC3Q9UPP2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
IQSEC3Q9UPP2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
IQSEC3Q9UPP2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
IQSEC3Q9UPP2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
IQSEC3Q9UPP2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms